Metoder och verktyg för programutveckling inom bioinformatik G2F

Om utbildningen

Den här kursen går igenom ett antal verktyg och metoder för utveckling av avancerade mjukvaror inom bioinformatiken. Huvudmomenten i kursen handlar om hur man arbetar med versionshantering av källkod, hur man paketerar mjukvara i diskreta miljöer, hur man på ett strukturerat sätt utvecklar mjukvara i ett team, samt hur man kombinerar olika mjukvaror till analysflöden. Föreläsningar och datorövningar kombineras för att gå igenom teorin och omsätta denna i praktik. Kursen förutsätter kunskaper om Unix och programmeringsvana i Python och R.

Behörighet

Kursen har följande godkända kurser som förkunskapskrav: BI122G Introduktion till datorverktyg för bioinformatik G1N och BI121G Bioinformatisk analys med Python 1 G1N (eller motsvarande kunskaper).Dessutom krävs: genomgången BI319G Expressionsanalys med R G1F med godkänt betyg på inlämningsuppgift 1 samt godkänt betyg för seminarium eller godkänt betyg på inlämningsuppgift 2 (eller motsvarande kunskaper). Då kursen är på fördjupningsnivån G2F krävs sammanlagt godkända kurser om minst 60 högskolepoäng i något eller båda ämnena bioinformatik och biovetenskap, där de ovan angivna kurserna ingår.

Rekommenderade förkunskaper: uh

Alla tillfällen (1)

Liknande utbildningar

• Programmeringsprojekt i bioinformatik G2FUniversitet/högskola
• Bioinformatisk analys med Python 2 G1FUniversitet/högskola
• Bioinformatisk analys med Python 1 G1NUniversitet/högskola
• Applikationsutveckling för bioinformatikUniversitet/högskola