Analys av data från massiv parallellsekvensering G2F

Om utbildningen

Massiv parallellsekvensering (MPS) generar korta sekvenser från ett stort antal (oftast många miljoner) DNA/RNA-molekyler. För att analysera dessa mängder av sekvenser är kraftfulla datorverktyg ett måste. I denna kurs får du bland annat lära dig hur man använder program som kan härleda en organisms fullständiga DNA-sträng genom att länka ihop miljontals MPS-sekvenser i rätt ordning. Du får också lära dig hur man kan studera aktivitetsmönster hos en organisms alla gener, med hjälp av program som analyserar MPS-sekvenser från RNA-prov. Ytterligare moment som ingår i kursen är att lära sig hantera analysprogram i en UNIX/Linux-miljö.

Behörighet

Kursen har följande godkända kurser som förkunskapskrav: BI122G Introduktion till datorverktyg för bioinformatik G1N och BI119G Introduktion till bioinformatik G1N.Dessutom krävs: genomgången BI319G Expressionsanalys med R G1F med godkänt betyg på inlämning 1 samt godkänt betyg på seminarium eller godkänt betyg för inlämning 2 (eller motsvarande kunskaper). Då kursen är på fördjupningsnivån G2F krävs sammanlagt godkända kurser om minst 60 högskolepoäng i något eller båda ämnena bioinformatik och biovetenskap, där de ovan angivna kurserna ingår.

Rekommenderade förkunskaper: uh

Alla tillfällen (1)

Liknande utbildningar

• Analys av sekvenseringsdata A1FUniversitet/högskola
• Bioinformatiska analysflöden för storskaliga sekvenseringsdata A1NUniversitet/högskola
• Expressionsanalys med R G1FUniversitet/högskola
• Statistiska metoder i genetikUniversitet/högskola